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东莞市中医院始建于1965年，现拥有新院本部和莞城分院两个院区，以及中心门诊部、莞城分院门诊部、公务员小区莞翠中医门诊部等三个门诊;下属机构有东莞市中医药研究所、东莞市老年病防治研究所、东莞市骨伤科研究所，即将成立东莞市骨伤科实验中心。医院是东莞市中医学会的挂靠单位;是东莞地区中药剂型改革中心;也是东莞地区唯一一所三级甲等中医医院。
东莞市中医院现有员工1505人，卫生专业技术人员中，具有高级职称184人，其中正高级职称51人，副高级职称133人;享受国务院政府特殊津贴专家3人，国务院评定为有突出贡献的自然科学家2人，广东省名中医5人，广东省优秀中医临床人才3人，东莞市科技领军人才1人，东莞市科技领军后备人才1人;在站博士后1人，博士8人，硕士128人。担任国家级学术团体常务委员或委员5人，省级学术团体副主任委员7人。在卫生专业技术人员中，执业医师449人，其中中医类别执业医师290人，占比64.59%;药学专业技术人员131人，其中中药专业人员49人，占比37.40%。
医院重视学科建设，临床科室达到26个，其中内科病区10个、骨伤科病区7个。中医药内涵建设成绩突出，已形成国家、省、市重点专科梯队，现有国家临床重点专科建设单位1个(脾胃病科);国家中医重点专科1个(脾胃病科);国家中医重点专科建设单位1个(骨伤科);广东省中医重点专科2个(骨伤科、脑病科);广东省中医重点专科建设项目5个(心血管科、内分泌科、针灸科、肛肠科、急诊科);东莞市临床医学重点专科8个(骨伤科、脾胃病科、脑病科、心血管科、内分泌科、针灸科、肛肠科、急诊科)。另有普外科已申报东莞市临床医学重点专科，目前进入了评审阶段。医院重视治未病体系建设，治未病科成为“广东省中医治未病健康工程试点单位”。医院重视对中医名家临症验方的挖掘，建有全国名老中医传承工作室2个(何炎燊、何世东)，广东省名中医传承工作室1个，东莞市名中医传承工作室9个，开展全国名老中医药专家学术经验传承工作4批，广东省名中医师承项目6个，东莞市名中医师承项目3个。同时，积极开展中药新制剂的研发和剂型改造，目前院内中药制剂有30个品种，临床应用疗效显著，深受患者群众欢迎。
医院先后成为广州中医药大学非直属附属医院，广东省第三批博士后创新实践基地，国家级中医住院医师规范化培训基地。现有博士研究生导师1人，硕士研究生导师20人，兼职教授50人，讲师1人，已形成博士后、硕士、本科多层次的教学体系。目前，在院培养博士后1人，硕士研究生22人，实习生130余人，规培生及全科医生170人。在对外交流方面，与香港威尔斯亲王医院、北京朝阳医院、积水潭医院、湘雅医院、广东省中医院、意大利佛罗伦萨市锡椰那大学医学院等建立了学术交流关系，每年选派优秀中青年骨干前往进修交流。
